Biyomühendislik Bölümü

Biyoinformatik ve Sistem Biyolojisi Laboratuvarı

Yapılan Uygulamalar

METABOLİK AĞYAPI MODELLEMELERİ

BİYOİSTATİSTİK

TRANSKRİPTOMİK VERİ MADENCİLİĞİ

MATEMATİKSEL MODELLEME

PROTEİN ETKİLEŞİM AĞI MODELLERİ

BİYOMOLEKÜLER SİMÜLASYONLAR

MOLEKÜLER KENETLENME SİMÜLASYONLARI

Gerçekleştirilen Projeler

Uyarılmış Kök Hücrelerin Oluşum ve Başkalaşım Süreçlerinin Sistem Biyolojisi ve Biyomühendislik Yaklaşımlarıyla Modellenerek Geliştirilmesi TÜBİTAK ARDEB 1001 Projesi

Parkinson Hastalığı için Transkriptom verilerinin ve Hücre içi Ağyapıların Biyoinformatik Analizi: İlaç Hedefi ve İlaç Geliştirilmesi TÜBİTAK ARDEB 1003 Projesi

Omik Verilerinden Hücresel Ağyapıların Çıkarımı için Yeni Bir Hesaplamalı Yöntemin Geliştirilerek İyileştirilmesi ve Kök hücrelere uygulanması TÜBİTAK ARDEB 1002 Projesi

Tümör Örneklerindeki Nadir Hücre Türlerinin Belirlenmesi ve Prognostik Özelliklerinin İncelenmesi TÜSEB TA-1 PROJESİ (2020-2022)

Tümör ve Mikroçevrelerinin Üç Boyutlu Matematiksel Modellerinin Geliştirilmesi TÜBİTAK 1001 PROJESİ (2021-2024)

Alzheimer Hastalığı için RNA-seq verilerinden faydalanarak Kişiye Özel Moleküler Etkileşim Modelleri geliştirilmesi ve Hastalık Mekanizmalarının Aydınlatılması TÜBİTAK 1001 PROJESİ (2021-2024)

Transkriptom verilerinin genom ölçekli metabolik ağlara haritalanmasıyla Parkinson Hastalığının in vivo ve in vitro modellerinin moleküler karakterizasyonu: biyobelirteç ve ilaç adayları belirlenmesi TÜSEB TA-1 PROJESİ (2020-2022)

Cİhazlar / Yazılımlar

Laboratuvar Sorumlusu

Doç. Dr. Tunahan ÇAKIR

tcakirgtu.edu.tr

Dr. Öğr. Üyesi Pınar PİR

pinarpirgtu.edu.tr

Dr. Öğr. Üyesi Onur SERÇİNOĞLU

osercinoglugtu.edu.tr